Publikace obsahuje celkový rejstřík ke všem devíti svazkům Květeny České republiky. Skládá se ze dvou částí, rejstříku vědeckých jmen a rejstříku českých jmen. Rejstřík vědeckých jmen je strukturovaný a zahrnuje platná jména taxonů uvedených v jednotlivých svazcích, jejich synonyma, odkazy na tabule a mapy jednotlivých taxonů. Rejstřík českých jmen obsahuje pouze odkaz na stranu hlavního zpracování daného taxonu. Celkový rejstřík slouží nejen k rychlému vyhledávání informací o taxonech zpracovaných v Květeně ČR, ale zároveň i jako přehledný soupis taxonů naší květeny.